激光掃描共焦顯微術的基本原理是，在細胞內(nei) 一個(ge) 任意選定的深度上將激光束聚焦成線度接近單個(ge) 分子的極小的斑點，並在細胞內(nei) 一定深度的層麵上進行掃描，通過光學係統，即可得到細胞一個(ge) 層麵的清晰圖象。連續改變激光的聚焦深度，在一係列的層麵上進行掃描，最後獲得整個(ge) 細胞的三維圖象。利用目前已達上千種與(yu) 細胞內(nei) 不同分子（或離子）特異性結合的熒光探針，人們(men) 就可以直接觀測活細胞中各種重要生物分子的位置、運動以及與(yu) 其它分子的相互作用等。例如觀測細胞骨架上的微管、微絲(si) 與(yu) 中間纖維，觀察信號轉導通路上的各種重要的酶與(yu) 信使分子，還可利用基因重組技術將自身已有的熒光蛋白引入細胞，用激光掃描共焦顯微鏡研究基因的表達、細胞內(nei) 蛋白質的相互作用與(yu) 細胞內(nei) 的“交通”等。熒光探針和熒光蛋白與(yu) 激光共焦顯微術的結合，使人們(men) 能夠看到細胞內(nei) 一個(ge) 既複雜又異彩紛呈的世界。