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瑞典科學家實現用DNA鏈3D打印納米級對象

星之球激光 來源:天工社2015-07-24 我要評論(0 )   

近日,瑞典研究人員開發出一種完全使用DNA單鏈構建納米級結構和形狀的技術。有讀者可能會(hui) 問,這種技術有什麽(me) 用?難道我們(men) 還要用D

近日,瑞典研究人員開發出一種完全使用DNA單鏈構建納米級結構和形狀的技術。有讀者可能會(hui) 問,這種技術有什麽(me) 用?難道我們(men) 還要用DNA3D打印一個(ge) 兔子或者甜甜圈?其實,該技術的主要作用是創建出DNA大小的結構使其與(yu) 人類細胞以及構成細胞的各種分子進行相互作用。人們(men) 可以對這些結構進行特殊設計,使其能夠為(wei) 人體(ti) 提供救生藥物或營養(yang) 物質,其形狀將決(jue) 定它們(men) 將會(hui) 如何或在什麽(me) 時候被人體(ti) 吸收。

這就為(wei) 徹底治愈人類麵臨(lin) 的一些重大疾病帶來了希望。比如說癌症,醫生們(men) 可以使用這種技術關(guan) 閉癌細胞的生長能力或者使其周圍組織腐爛。這些構建體(ti) 也可用於(yu) 傳(chuan) 遞藥物,使其被吸引到身體(ti) 的特定部分,並隻影響該區域,而不是破壞周圍的組織。據了解,這種折疊DNA的方法被稱為(wei) “DNA折紙術(DNA origami)”,雖然它並不是第一個(ge) 被設計用來構建納米級DNA結構的方法,但是卻被認為(wei) 是最通用、最簡化的一種方法。


實時自組裝的
DNA納米結構

“三維DNA折紙術傳(chuan) 統上采用密排螺旋,它能夠產(chan) 生實心磚般的形狀,人們(men) 可以使用幹態負染色透射電子顯微鏡看到它。但是這種新的技術將DNA折紙術用在了生物研究中,但是在這個(ge) 領域,DNA結構的有些屬性,比如在低鹽條件下的穩定性和結構的靈活性十分重要,因此這裏更加青睞單層、中空的結構。我們(men) 在這裏報告的這種新的設計模式,采用了單獨的雙螺旋作為(wei) 結構元件,而不是密排的螺旋束,從(cong) 而完全緩解了對於(yu) 鹽分進行非生理濃縮的需要。使得科學家們(men) 有望在細胞生物學方麵以及活的有機體(ti) 內(nei) 進行更多的實驗,因為(wei) 該模型係統條件和真正的生物環境之間更加匹配。”研究人員在這個(ge) 星期發表在《Nature》上的論文中說。

該論文的主要作者Bjorn Hogberg博士和他的研究小組已經能夠用DNA單鏈構建出幾種形狀和配置,其中包括球形、棒形、瓶形、人形,甚至包括一隻兔子。盡管DNA的直徑通常會(hui) 小於(yu) 100納米(0.0001毫米),但是這些DNA的構建體(ti) 還不可能做到很小。不過這也不是業(ye) 餘(yu) 的DNA設計師所能做到的。雖然這些形狀很容易設計,而實際打印出來則需要大量的資源,比如您需要對DNA進行排序並將它們(men) 吸取在一起,隻有專(zhuan) 業(ye) 的研究實驗室才有可能做到這些。

不過Hogberg的團隊已經發布了完整的算法代碼,希望其他實驗室將能夠加入進來,簡化其技術。


成功組裝
DNA納米結構的過程。

該技術的操作過程是這樣的,研究人員先將所需要的形狀輸入到計算機,然後通過一種專(zhuan) 門的算法計算出以最有效的方式將一個(ge) 長長的、連續的DNA鏈折疊成特殊的形狀。然後,還有一些DNA短鏈會(hui) 起到“訂書(shu) 針”的作用,會(hui) 幫助維持已經形成的DNA形狀,並將其固定在適當的位置。這些“DNA訂書(shu) 針”主要由兩(liang) 個(ge) DNA序列構成,它們(men) 將會(hui) 與(yu) DNA長鏈上的特定點相匹配。這些序列會(hui) 與(yu) 這些匹配點彼此吸引並與(yu) 長鏈結合,使其作為(wei) 一個(ge) 穩定的圍觀生物構建體(ti) 保持在一起。


可以用基本的
3D軟件編輯DNA結構

所以從(cong) 字麵上說,DNA折紙術其實也很簡單,一旦選定形狀之後,它們(men) 是自動構建,幾乎不需要人工幹預。計算機算法會(hui) 簡單地提供一個(ge) 構建所需3D對象所需要的DNA鏈列表;然後該列表被發送到實驗室,在這裏將會(hui) 合成所需各個(ge) 單獨的DNA鏈;最後,當所有的DNA鏈被混合在一起的時候,就會(hui) 根據設計的互相結合,進行自組裝從(cong) 而形成指定的形狀。

這種算法是由在瑞典Karolinska學院的Hogberg團隊開發的,並得到了來自芬蘭(lan) Aalto大學的一個(ge) 團隊的幫助。他們(men) 共同發現,這些由單鏈、動態成形的DNA構建體(ti) 是在分子水平上與(yu) 人體(ti) 相互作用的理想結構。為(wei) 了能夠輕鬆地創建這些形狀,他們(men) 利用DNA的性質去模擬多邊的3D形狀,而這些3D形狀可在計算機設計中用於(yu) 構建3D模型。這種方法不僅(jin) 更加有效,而且更加容易與(yu) 普通的3D設計和3D打印軟件兼容。

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